5000元的工资缴纳五险一金的金额与其所在城市、单位缴费比例和缴费基数等有关。社保的缴费基数是以该员工上一年度的月平均工资为准,若该员工的社保缴费基数为5000元,以北京市为例,其缴纳金额为：1.养老保险：通常个人需缴纳8％,则其缴纳金额为5000*8%=400元。2.医疗保险：通常个人需缴纳2％,则其缴纳金额为5000*2%=100元。3.失业保险：通常个人需缴纳0.2%,则其缴纳金额为5000*0.2%=10元。4.生育保险和工伤保险,个人无需缴纳。5.住房公积金：通常个人需缴纳12%,则其缴纳金额为5000*12%=600元。则该员工缴纳五险一金共计1110元。