截至2016年09月30日，有10个股东增持，共增持21154.45万股，占总股本的70.51%。

北京华大基因研究中心有限公司是空港公司的股东，持有空港公司股份752393股。空港公司并不持有北京华大基因研究中心有限公司的股份。

北京空港科技园区股份有限公司（以下简称“本公司”或“公司”）是由北京天竺空港经济开发公司作为主发起人，联合北京顺鑫农业股份有限公司、深圳市空港工贸发展有限公司(现更名为深圳市空港油料有限公司)、北京华大基因研究中心、北京空港广远金属材料有限公司以发起方式设立，于2000年3月28日在北京市工商行政管理局登记注册，截至2014年底注册资本及股本为25,200万元；2015年12月11日，经中国证券监督管理委员会下发的证监许可[2015]2874号《关于核准北京空港科技园区股份有限公司非公开发行股票的批复》文的核准，公司非公开发行新股不超过48,000,000股。公司实际非公开发行人民币普通股（A股）48,000,000股，每股面值人民币1元，每股发行价人民币12.50元，全部由国开金融有限责任公司以货币资金出资认购。

作为国内基因测序行业龙头，华大基因的上市计划一直备受市场关注。12月18日晚间，其终于在证监会最新披露的IPO排队名单中现身。同日发布的预披露文件显示，华大基因本次拟公开发行不低于4000万股，募投建设的云服务生态系统、医学检验解决方案平台升级、精准医学服务平台升级、基因组学研究中心、信息系统升级等五大项目共需资金17.32亿元。华大是空港股份的创始人之一。公司主营房地产开发的天竺空港工业区，是北京三大开发区之一。实际控制人为北京市顺义区国有资产监督管理委员会。